El Doctorado está orientado a la aplicación y generación de los conocimientos en los sectores productivos relevantes para la economía del país, tales como: Energía, Minería, Medio Ambiente y Biotecnología.
Sus líneas de investigación comprenden los procesos metalúrgicos y sistemas particulados; modelación, simulación y optimización de procesos; termofluidodinámica; biotecnología, bioprocesos y procesos de separación y; combustión, conversión de energía y contaminación atmosférica.